• Wednesday June 26,2019

Kategori - personlig genomik


Fri 23andMe genotypning

Fri 23andMe genotypning

Från OpenSNP: I slutet av förra året meddelade vi att vi fick lite finansiering från den tyska WikiMedia-stiftelsen för att få fler människor - som är villiga att dela sina resultat - genotyperade. Vi har nu avgjort en process som skulle göra det möjligt för oss att utföra projektet utan alltför många problem. Från och med

Den totala informationsvärlden

Den totala informationsvärlden

Glad tacksägelse (om du är amerikansk)! Det har varit en upptagen dag i världen av personlig genomik. Av en slump har jag en medhörig kommentar i Genome Biology, Rykten om konsumentgenomernas död är kraftigt överdrivna (den skrevs och återges). Om du inte har det, läs FDA: s brev och 23andMe svar, så mycket som det finns en just nu. Sedan Sl

Stamtavla + Personlig genomik = Mer insikt

Stamtavla + Personlig genomik = Mer insikt

Uppdatering: Funktionen var alltid där. Bara svårt att hitta. 23andMe gjorde en webbplats omkonstruktion. Det mesta av det är användargränssnittet, men det är en speciell cool funktion: om du har en persons stamtavla upp till farföräldrar kan du se vilken allel de ärvde. Välj bara "Familjegenskaper" under "Familj och vänner". Du får då

Genomsekvensering av de ofödda

Genomsekvensering av de ofödda

Noninvasiv helgenesekvensering av en mänsklig fetus: Analys av cellfritt foster-DNA i moderns plasma håller löftet för utvecklingen av icke-invasiv prenatal genetisk diagnostik. Tidigare studier har varit begränsade till detektering av fostretrisomier, specifika paternalt ärftliga mutationer eller att genotypa gemensamma polymorfier med användning av material som erhållits invasivt, t ex genom koronisk villusprovtagning. Här ko

Världen är som den borde vara i personlig genomik

Världen är som den borde vara i personlig genomik

Jag har haft kul med min dotters personliga genomik. Du ser, hon har hela hennes stamtavla ut till r = 1/4. Så, till exempel, bidrar bidrag från hennes morföräldrar till att handla om denna ordning: Paternal farfar = 0, 28 Paternal mormor = 0, 22 Mormor morfar = 0, 23 Mormor = 0, 27 Jag har också beräknat antalet rekombinationer som inträffade fram till de gameter som fusionerades för att skapa henne. Det ko

Köparen akta dig vid anestesprovning!

Köparen akta dig vid anestesprovning!

Över på Genomes Unzipped Vincent Plagnol har lagt upp ett inlägg, överdrifter och fel i främjandet av genetisk avkommandestestning, vilket enligt min mening är en underdimensionerad och mjukt touch gammaldags "fiskning" av uttalanden av en talesman för en outfit kallad Storbritanniens DNA. Hela

AncestryDNA accepterar nu nödvändigheten av att hämta data

AncestryDNA accepterar nu nödvändigheten av att hämta data

Den juridiska genealogen pekar på att AncestryDNA nu ska arbeta för att tillåta användare att ladda ner sina data. Här är det specifika avsnittet: AncestryDNA anser att våra kunder har rätt till egna genetiska data. Det är trots allt ditt DNA. Så vi arbetar för att ge tillgång till dina råa DNA-data i början av 2013, vilket inkluderar relaterade säkerhetsförbättringar för att säkerställa säkerheten under varje steg i processen. När vi flyttar fram

1 av 100 dra nytta av hela genom-sekvensering

1 av 100 dra nytta av hela genom-sekvensering

Kanske. New York Times har en del ut som granskar modet för att sekvensera genomerna av barn som har mystiska sjukdomar. Numren är vad som är viktigt här tror jag: För några år sedan var denna typ av test så svår och dyr att det i allmänhet endast var tillgängligt för deltagare i forskningsprojekt som de som sponsras av National Institutes of Health. Men priset

Förtroende för inferens i fylogenetiska dataset

Förtroende för inferens i fylogenetiska dataset

För några veckor sedan lade jag upp en ny dataset i mitt förråd. Såsom är min vanliga övning nu kan populationerna hittas i .fam-filen. Men jag har lagt till mer i detta. Jag måste omskriva min ADMIXTURE-handledning snart, så jag trodde att jag skulle ta upp en viktig fråga vid tolkning av dessa dataset med hjälp av klustringsmetoder: man måste förstå att slutsatser inte kan vila på ett enda resultat. Snarare måste

23andMe kontroverser i den genetiska släktforsknings gemenskapen

23andMe kontroverser i den genetiska släktforsknings gemenskapen

Några läsare har pekat på kontroverser som har att göra med 23andMe 's "användarvillkor". Du kan läsa om det på din genetiska genealog, som har två inlägg på frågorna. Jag tycker att kärnan är att de tidiga entusiasterna för personlig genomik i den genetiska släktforskningen inte kan stödja intäkterna hos ett företag som 23andMe . Frågan för föret

Laura Hercher övertygar mig om att det inte finns något icke-självintresserat fall för genetisk paternalism

Laura Hercher övertygar mig om att det inte finns något icke-självintresserat fall för genetisk paternalism

Över på David Dobbs 'weblog Laura Hercher har en gästpost upp med rubriken Case for Selective Paternalism i Genetic Testing. Här är några relevanta avsnitt: Vilket tar mig tillbaka till denna fråga om paternalism. Jag håller med om att det inte är meningsfullt att lägga upp hinder för nyfikna och motiverade individer som vill fråga deras genom för information, dock laced med osäkerhet eller fara. Men förlåt o

År 2011 ....

År 2011 ....

Följ upp till föregående inlägg, (Via Ed), Fetal genscreening kommer till marknaden: Fram till förra veckan betraktade undersökningen av ett foster DNA för indikationer på genetiska abnormiteter att tappa in i moderns livmoder med en nål. Nu är det ett test som kan göra det med ett litet urval av moderns blod. MaterniT2

Reglera dietindustrin!

Reglera dietindustrin!

Brandom Keim lämnar denna kommentar: Det är lätt att se genomisk datareglering i romantiska berättelser - De snygga små killarna som vill vara fria! De stora, dåliga institutionerna som vill kontrollera dem! - och det är också en fälla. Att tolka genomisk information på ett medicinskt användbart sätt är väldigt mycket komplicerat. Det är lätt

Den genetiska öppenhetens era är nästan här

Den genetiska öppenhetens era är nästan här

Matera har en mycket lång funktion av min vän Virginia Hughes, oskadad, om hur personlig genomik förändras och ibland stör familjeförhållanden. Jag satt i en session vid konsumentgenetikskonferensen förra veckan, och en publik medlem uttryckte oro över hur genetiska resultat skulle kunna orsaka familjeavbrott. Denna i

Öka pengar på Google+ mot Facebook

Öka pengar på Google+ mot Facebook

Som några av er vet har jag letat efter en malagasisk genotyp. Jag hittade en. Eller åtminstone en potentiell. Vid denna tidpunkt behöver jag få personen genotypad. Jag har skickat satsen utomlands, och inom 1-2 månader borde jag få en inlägg som analyserar den här personens förfaderliga tillhörigheter (som är av Betsileo-bakgrunden). Allt som

Efter min tidigare inlägg började min fru göra forskning online. Det autosomala dominerande tillståndet som jag har är nästan säkert lokaliserat till en viss kromosom (det finns en stor effekt QTL där det är starkt associerat med mitt tillstånd). Dessutom ärver jag detta tillstånd från min mamma. Min dotter

Personlig genomik blir mycket personlig

Personlig genomik blir mycket personlig

Dan MacArthur pekar på mig på det här trevliga inlägget på Daily Kos, Vårt Genoom avkodade: Hur företag som 23andMe utvecklar Field of Personal Genomics: . Under de senaste åren har dock flera privata bioteknikföretag startat med att erbjuda en "personlig genomfattande tjänst" som innebär att sekvensering av de mest variabla delarna av vårt DNA. Målen är e

Är det etiskt att publicera ditt barns genom?

Är det etiskt att publicera ditt barns genom?

Det är vad en läsare nedan frågar. I viss mån undrade jag detta när Dan MacArthur och Ilana Fisher satte deras genotyper där ute. De har en son, och så nu kan du skapa en sannolik riskmatris för Tobias MacArthur eftersom du har sina föräldrars genotyper. Eftersom han bara är lite över ett år, tvivlar jag på att någon kunde få sitt samtycke i frågan. Men detta är lå

Jag lovar mitt fulla genom till det offentliga området

Jag lovar mitt fulla genom till det offentliga området

Jag förväntar mig att få mitt fulla genom sekvenserat om några år senast. När det händer försöker jag och placerar det online på ett offentligt arkiv. Varför? Det finns något av en kyckling och äggfråga med nytta av genomer. Ju mer du har där ute, desto mer juice kan du klämma på. Jag kommer också att lägga till fenotypisk information också. Du är förmodligen