• Wednesday June 26,2019

Kategori - genetik


Personliga genomik & sällsynta populationer anteckningar

Personliga genomik & sällsynta populationer anteckningar

Jag kommer att ta upp två punkter i det här inlägget. Nästa möjliga mål för att få en undersampled befolkning, och de malagasiska resultaten. Först, massor av bra inlagor när det gäller befolkningar som är undersampled. Några av dem finns faktiskt redan i dataseten. Till exempel är Burusho och Kalash i HGDP. Det har ocks

Att odla en bättre människa - vi har tekniken

Att odla en bättre människa - vi har tekniken

För några år sedan sprängde utvecklingsgenetikern Armand Leroi på scenen med engageringsboken, mutanter och en kontroversiell upphandling där han försökte rehabilitera begreppet ras. Leroi Aldrig en för att skämta sig från kontroversen Armand har publicerat en ny uppsats, Neo-eugenikens framtid, där han lägger ut vad som händer och eventuellt kommer att ske, ur en evolutionär biologs perspektiv. Det fantastis

Det förflutna är ett oupptäckt land

Det förflutna är ett oupptäckt land

En nyligen publicerad tidning i Genome Research- titeln Avkoppling av selektiv begränsning på hund mitokondriellt DNA efter domesticering drar slutsatsen att domesticering av vargar och deras omvandling till hundar underlättades genom avslappnat urval och ökad latent variation, varifrån efterföljande urval kunde fungera. Här

På den indianska förfader

På den indianska förfader

Spår av afrikansk och amerikansk blandning i söder om Sahara i gamla lager europeiska amerikaner: Vissa människor tycker om att överskatta extrauropeisk blandning i gamla lager amerikaner, medan andra tar ställningen att det aldrig hände. Det hände, och jag kan bevisa det, men absolut inte i stor utsträckning, annars skulle jag inte böja över bakåt för att hitta den. I grund oc

Val av nivåer - den kommande debatten

Val av nivåer - den kommande debatten

Wired har en blogginlägg där de reproducerar texten i en e-postutbyte med Bert Hoelldobler, en entomolog som samarbetar med EO Wilson på en ny bok som kommer att argumentera för relevansen av högre organisationsnivåer i evolutionära processer. I den kooperativa genen framkallar den evolutionära biologen Mark Ridley hur multicellulära organismer framträder från en koalition av gener, alla med samma intresse på grund av deras fängelse inom individen (deras replikation förmedlas av könsbestämningarna). Jag antar att

Mixed-race men homogent utseende?

Mixed-race men homogent utseende?

För flera år sedan frågade Oprah Winfrey Tiger Woods vad han skulle säga till människor som säger att när de ser honom ser de en svart man. Frågan var att några afroamerikaner invände Woods "påstående att han var multiracial, Cablinasian, vilket återspeglade det faktum att han var ancestrally 1/2 asiatisk, 1/4 afrikansk, 1/8 europeisk och 1/8 indianer. Woods är oc

 "omics " + (analys & i silico) = tillbaka till framtiden

"omics " + (analys & i silico) = tillbaka till framtiden

Tja, jag har haft kul att läsa John Hawks 'inlägg på termen "genomics", och jag är säker på att Evolgen tror att jag också är upptagen med de tre gamla tjuven av befolkningsgenetik. men denna artikel, äktenskap av matematik och genetik smidar nytt vetenskapligt landskap är snällt, det förflutna är framtiden! Trots allt

Genetiker är smala ett ** hål?!?!

Genetiker är smala ett ** hål?!?!

Över på Gregs plats noterar Brian Switek: Tack för länken Greg (och tack för komplimangen, Steve). Jag har i allmänhet varit imponerad med Coynes populära artiklar, speciellt med tanke på att han tycks gå ut ur hans sätt att attackera Gould och evo-devo när det verkar lämpligt att göra det (vilket är ungefär när som helst, tydligen). Kritik och kon

Inflammatorisk tarmsyndrom är naturens bieffekt

Inflammatorisk tarmsyndrom är naturens bieffekt

Förra veckan publicerade Luke Jostins (snart för att vara Dr Luke Jostins) ett intressant papper i Nature . För att vara rättvis har detta papper en omfattande författarlista, men från vad jag förstår är detta frukten av den första författarens doktorand. projekt. I alla fall kan du kanske veta Luke eftersom jag har använt sin loesskurva på hominin-encefalisering i flera år. Hans bröd oc

1 av 200 män direktavkomlingar av Genghis Khan

1 av 200 män direktavkomlingar av Genghis Khan

År 2003 rapporterade ett banbrytande historiskt genetikpapper resultat som tyder på att en betydande andel män i världen är direkta efterkommande av Genghis Khan. Med direktlinje menar jag att de bär Y-kromosomer som tycks ha kommit ner från en individ som bodde ungefär 1000 år sedan. Eftersom Y-kromosomer endast överförs från far till son, skulle det innebära att Y är en rekord av ens patrilineage. Genghis Khan

Betydelsen av representativitet

Betydelsen av representativitet

För några veckor sedan när jag publicerade resultatet av en hög sannolikhet för ett delvis östligt ursprung för Mundari-folket fick jag ett meddelande via Facebook om att artikeln inte var relevant för de flesta sydasiatiska, eftersom endast 1-2% talade ett Mundari-språk (tillsammans med tips till gamla föråldrade artiklar). Jag svara

Hur stor behöver N vara?

Hur stor behöver N vara?

Beräkning av antalet osynliga varianter i det humana genomet: . I överensstämmelse med tidigare beskrivningar visar våra resultat att den afrikanska befolkningen är den mest mångfalden när det gäller antalet varianter som förväntas existera, de asiatiska befolkningarna minst olika, med den europeiska befolkningen däremellan. Dessutom

Varför framtiden blir inte genetiskt homogen

Varför framtiden blir inte genetiskt homogen

Under läsningen av grundarna för evolutionär genetik mötte jag ett kapitel där den sena James F. Crow erkände att han hade en ny inblick varje gång han läser RA Fishers Genetiska teori om naturligt urval. Detta ledde till att jag satte ner The Founders of Evolutionary Genetics efter avslutat Crows kapitel och hämtar min kopia av The Genetical Theory of Natural Selection. Jag har

Brun björn!  Isbjörn!

Brun björn! Isbjörn!

Björnar är stora affär idag. Jag har talat om det här förut, så jag vann inte poängen i det här inlägget. Snarare vill jag övertyga dig om att det finns ett riktigt intressant papper i PLOS Genetics just nu, Genomic Evidence for Island Population Conversion löser konfliktande teorier om isbjörnsutveckling. Jag vet at

En gen stannar äggstockarna från att omvandlas till testiklar

En gen stannar äggstockarna från att omvandlas till testiklar

I vetenskapen får vi inte ofta prata om manlig förtryck, men en ny upptäckt ger oss bara en sådan chans. Det visar sig att äggstockar bara kan förbli äggstockar genom att ständigt undertrycka sin förmåga att bli manlig. Stäng en enda gen, och vuxna äggstockar blir till testiklar. Att vuxna vävnader kan omvandlas på detta sätt skulle vara överraskande nog, men det är verkligen förvånande att göra en förändring av en enda gen. Som embryon är våra

Pappa luktar inte rätt

Pappa luktar inte rätt

Doft av pappa kontrollerar dotterns mognad. I grund och botten fann författarna i en undersökning att om biologiska fäder är omkring, mognar tjejer långsammare. Det här låter som Harpending-Draper-modellen av farbrist, men med en något mer biologisk kant. Forskarna föreslår att den sena löptiden minskar risken för inavel. Uppriktigt

Kognitiva morfer i Drosophila

Kognitiva morfer i Drosophila

Naturlig polymorfism som påverkar lärande och minne i Drosophila : Att veta vilka gener som bidrar till naturlig variation av inlärning och minne skulle hjälpa oss att förstå hur skillnaderna i dessa kognitiva drag utvecklas bland populationer och arter. Vi visar att en naturlig polymorfism vid födningsområdet ( för ) locus som kodar för en cGMP-beroende proteinkinas (PKG), påverkar den associerade olfaktoriska inlärningen i Drosophila melanogaster . Inan-analy

Sydsjön historia genom gener

Sydsjön historia genom gener

Jag har bloggar en rättvis bit om förhållandet mellan historia och genetik (se här, här och här), både som en parameter för att forma händelseförloppet (t.ex. immunologiska profiler eller genom genkulturens samvolution) och som ett verktyg för att spåra ut fylogenetiska relationer mellan människor och utplåna demografiska detaljer. Det händer s

Anteckningar om Sewall Wright: Migration

Anteckningar om Sewall Wright: Migration

David fortsätter sin serie om tanken på den stora evolutionära genetikern Sewall Wright. Dagens inlägg, Anteckningar om Sewall Wright: Migration. För det första den allmänna: Fortsatt min serie med anteckningar om Sewall Wrights befolkninggenetik, jag kommer till migrationens ämne. Detta är viktigt för att förstå skillnaderna mellan Wright och RA Fisher om rollen av genetisk drift i evolutionen. Fisher och

Hårfärgens genetik

Hårfärgens genetik

En läsare mailade mig frågar om genetiken i hårfärg. Sedan jag har diskuterat ämnet innan jag bara pekade på dem på frågan om ämnet på min andra blogg. Men jag trodde det kan vara bra att direkt svara på två specifika frågor: Varför har många människor mycket ljusare hår under barndomen? Samma anledning